Al igual que ocurre con las donaciones de sangre, los trasplantes de órganos son otra posible vía de transmisión de la enfermedad de Chagas.

Puesto que las medidas de control de los trasplantes de órganos son diferentes en cada país, a las personas que hayan recibido transplantes de órganos en América Latina o de un donante latinoamericano se les recomienda que en caso de duda acudan al médico para hacerse un chequeo.

Una persona que ya sepa que está afectada por la enfermedad de Chagas podría ser donante de órganos, siempre que tome la precaución de notificarlo al personal sanitario y estos puedan tomar las decisiones pertinentes.